Сюжет игры рассказывает о Джеймсе Сандерленде, который получает письмо от своей покойной жены Мэри. В письме она просит его встретиться с ней в городе Сайлент-Хилл, который имеет особое значение для них обоих. Джеймс отправляется в город, чтобы узнать правду, но вскоре сталкивается с существом по имени Пирамидоголовый и группой людей, которые борются со своим травмирующим прошлым.