Age of Empires 3 - стратегия в реальном времени, события которой развернутся в 1565 году. Вы возьмете под управление героя по имени Морган Блэк. Он - член Мальтийского ордена. В его задачи входит защита цитадели от Османской империи во главе с Сахином. В процессе сражения Морган находит писание Круг Оссуса, описывающее некое Лунное озеро. Герой отправляется в Новый Свет, чтобы отыскать легендарное место.