Действие Pioner разворачивается на загадочном архипелаге, который постепенно погружается во мрак. С каждым очередным «синим приливом» погибает всё больше людей. Пришло время разобраться в причинах катастрофы и нанести удар по неведомому врагу, скрывающемуся в тени.

Игрокам предстоит не только пройти основную сюжетную линию, но и окунуться в многообразие фракций, событий и заданий по всей территории архипелага. Здесь можно выступить в роли наёмника, бандита, торговца, исследователя и многих других. Такое разнообразие позволит каждому игроку найти себе занятие по душе и почувствовать свою причастность к происходящему.